In einer Schenkungsurkunde aus der Zeit Karls des Großen wurden 799 erstmals die „Burg zu Linze“ und die Martinskirche erwähnt. 

Kaiser Friedrich III. residierte hier bis zu seinem Tode 1493. Heute können Sie noch die Befestigungsmauern seiner Burg, die Bastionen und das Friedrichstor mit der Inschrift A.E.I.O.U. (das vermutlich: „Alles Erdreich ist Österreichs Untertan“ bedeutet) bewundern.

Der große Stadtbrand von 1800 zerstörte den Südflügel, der im Kulturhauptstadtjahr 2009 in moderner Stahl–Glas–Architektur nach Plänen von Martin  Emmerer,  Hansjörg  Luser und Clemens Luser  (HoG  architektur) neu errichtet und eröffnet wurde. Hier befindet sich das Schlossmuseum, das größte Universalmuseum Österreichs an einem Ort.